RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 INHBEP58166 350 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 FRS2Q8WU20 508 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 GNRHR2Q96P88 292 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 CYP7B1O75881 506 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF394Q53GI3 561 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC103Q8IW40 242 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT11Q96G61 164 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM209Q96SK2 561 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 ABHD18Q0P651 414 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 WRNIP1Q96S55 665 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 KLHL18O94889 574 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF202O95125 648 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 AMER2Q8N7J2 671 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 CEP89Q96ST8 783 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 ADOQ96SZ5 270 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 GINM1Q9NU53 330 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 PLSCR1O15162 318 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 BVESQ8NE79 360 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 GIPC2Q8TF65 315 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 DGCR2P98153 550 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 CHRNA2Q15822 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 PHF19Q5T6S3 580 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 STEAP3Q658P3 488 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 IQCEQ6IPM2 695 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 EXTL1Q92935 676 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-202ENST00000367364 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-202ENST00000367364 SOX9P48436 509 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2A2P52657 109 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-202ENST00000367364 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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