RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 GNA11P29992 359 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MMP14P50281 582 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GUCY2FP51841 1108 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CDR1P51861 262 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 EVA1CP58658 441 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GUCY1A3Q02108 690 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RASSF7Q02833 373 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 IFT88Q13099 833 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PSMD2Q13200 908 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NEDD9Q14511 834 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RPS6KA1Q15418 735 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SNCBQ16143 134 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ASIC2Q16515 512 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TXNRD1Q16881 649 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM153CQ494X1 144 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MEI1Q5TIA1 1274 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SUSD4Q5VX71 490 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 HGSNATQ68CP4 663 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KCTD16Q68DU8 428 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RCSD1Q6JBY9 416 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARMC9Q7Z3E5 817 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NEK8Q86SG6 692 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 DGKHQ86XP1 1220 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 USP38Q8NB14 1042 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PNMA1Q8ND90 353 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RASGRP4Q8TDF6 673 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC15Q8TF66 581 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 IFT81Q8WYA0 676 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MS4A14Q96JA4 679 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PBKQ96KB5 322 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC114Q96M63 670 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEP63Q96MT8 703 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PSMB7Q99436 277 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KRT12Q99456 494 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLIN2Q99541 437 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ISCUQ9H1K1 167 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 C6orf50Q9HD87 102 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KLC4Q9NSK0 619 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC87Q9NVE4 849 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 BARHL2Q9NY43 387 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 DONSONQ9NYP3 566 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 EHD2Q9NZN4 543 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MCM8Q9UJA3 840 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLAAQ9Y263 795 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NHSQ6T4R5 1651 aa3.59□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 A0A0G2JS52 829 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ESYT2A0FGR8 921 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ESYT3A0FGR9 886 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYMKA6NI61 221 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 H0YGN5 161 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC188H7C350 402 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 BUB1O43683 1085 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 RASSF9O75901 435 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 KIF4AO95239 1232 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 FTCDO95954 541 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 GSTA1P08263 222 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CYP2D6P10635 497 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMARCA1P28370 1054 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC8A1P32418 973 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms