RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 STRN4Q9NRL3 753 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GMEB1Q9Y692 573 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF233A6NK53 670 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 AFMP43652 599 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHKA1P46020 1223 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF185O15231 689 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBTB43O43298 467 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM37O94972 964 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GHRP10912 638 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MLH1P40692 756 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLC1Q07866 573 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 OXER1Q8TDS5 423 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K14Q99558 947 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX33O43247 280 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM29Q14134 588 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 HLFQ16534 295 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 AIDAQ96BJ3 306 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARMT1Q9H993 441 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMYM6O95789 1325 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 P4HA2O15460 535 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ALADP13716 330 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PANX2Q96RD6 677 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 INIPQ9NRY2 104 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 HPSEQ9Y251 543 aa11.82□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM247A6NEH6 219 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAPPC3O43617 180 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA31D3P0C874 917 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCNFP41002 786 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERPINB4P48594 390 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRPC1P48995 793 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GUCY2DQ02846 1103 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MCL1Q07820 350 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP58Q5T655 872 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KANK3Q6NY19 840 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED15Q96RN5 788 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLIT3O75094 1523 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM1O75626 825 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNA14O95837 355 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITGA6P23229 1130 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDB1Q16531 1140 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 RESP18Q5W5W9 173 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCNJLQ8IV13 435 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MLKLQ8NB16 471 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CARD9Q9H257 536 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 VCXQ9H320 206 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.81□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms