RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR1Q13613 665 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CABP7Q86V35 215 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 IQUBQ8NA54 791 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC5A5Q92911 643 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX58Q96C10 678 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 USP25Q9UHP3 1055 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ARP10275 920 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 APLP1P51693 650 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 RASSF10A6NK89 507 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 TM4SF4P48230 202 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 NOGQ13253 232 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 DISC1Q9NRI5 854 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.34■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ASTN1O14525 1302 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT79Q5XKE5 535 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KANK3Q6NY19 840 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CALML4Q96GE6 196 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 CPA4Q9UI42 421 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 VAV3Q9UKW4 847 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-201ENST00000298838 B4DLN1 442 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 STRNO43815 780 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GAS7O60861 476 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PGK2P07205 417 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFN14P0C7P3 912 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 E2F4Q16254 413 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRX1Q86UT6 975 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRASP2Q96D09 838 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZIC5Q96T25 663 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 RIT2Q99578 217 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.33■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 TLR2O60603 784 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD10O75832 226 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK4P31152 587 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 STAT6P42226 847 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 STXBP2Q15833 593 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GNPTABQ3T906 1256 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 MAFGO15525 162 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ERMNQ8TAM6 284 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPNS2Q96L46 248 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 STK24Q9Y6E0 443 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 EDNRBP24530 442 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GSE1Q14687 1217 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR142Q7Z601 462 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CDHR1Q96JP9 859 aa23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCG1P19174 1290 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE4DQ08499 809 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R5CQ13362 524 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A4O43511 780 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH1A1P00352 501 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ADORA2AP29274 412 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CRHR2Q13324 411 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf99Q6UX52 265 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CUEDC2Q9H467 287 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS20O76081 388 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 POSTNQ15063 836 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.29■■□□□ 1.32
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