RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS22Q8NE09 1264 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS33Q8NF86 280 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TOP1MTQ969P6 601 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17RAQ96F46 866 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IWS1Q96ST2 819 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TET1Q8NFU7 2136 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PPFIA4O75335 1185 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 UPP2O95045 317 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PPTC7Q8NI37 304 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS5Q92905 334 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PLVAPQ9BX97 442 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM22Q9NS69 142 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 F2P00734 622 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ZXDAP98168 799 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 GPNMBQ14956 572 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB33Q86T24 672 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBP2Q969R2 916 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFLR1Q9H665 355 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRSQ13332 1948 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TRANK1O15050 2925 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A6Q14031 1691 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC24BO95487 1268 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A2P36021 539 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 BMPR1AP36894 532 aa9.21□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 CLUL1Q15846 466 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6KQ17RY6 165 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MCTP2Q6DN12 878 aa9.21□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 KAT2BQ92831 832 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.21□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB11O95342 1321 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 HAS3O00219 553 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM4AO75164 1064 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ARIH2O95376 493 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 EYA4O95677 639 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP1P03956 469 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RLBP1P12271 317 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 AVPR2P30518 371 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 LTBRP36941 435 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C2P49902 561 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 HYAL1Q12794 435 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF15Q12870 199 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF1Q13077 416 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MMRN1Q13201 1228 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 USH1GQ495M9 461 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 IER5LQ5T953 404 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH3Q86UC2 560 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RX5Q93086 422 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC14Q96N46 770 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PHOX2BQ99453 314 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC6Q9Y210 931 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CCER2I3L3R5 266 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC4O43929 436 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CHGBP05060 677 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF286BP0CG31 522 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFB3P10600 412 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
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