RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296343.9

RUBCN-202, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RUBCN, Length 2,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-202ENST00000296343 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CASP5P51878 434 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SP4Q02446 784 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RASSF7Q02833 373 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 KCNA1Q09470 495 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RASA3Q14644 834 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.7□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.067e-8■■■■□ 23.8
RUBCN-202ENST00000296343 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CCNE1P24864 410 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PBX1P40424 430 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CNGA4Q8IV77 575 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 JDP2Q8WYK2 163 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 EML1O00423 815 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PEX10O60683 326 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 POLD1P28340 1107 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 COASYQ13057 564 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PTPROQ16827 1216 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYH8P13535 1937 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 DCAF4Q8WV16 495 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SMARCA1P28370 1054 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SPAG1Q07617 926 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 KCNB1Q14721 858 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SLC35F6Q8N357 371 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ABCB11O95342 1321 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYH4Q9Y623 1939 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 LGALS16A8MUM7 142 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CLIC2O15247 247 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MSH4O15457 936 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYO1BO43795 1136 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SRGAP2O75044 1071 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 INPP5BP32019 993 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 UBXN4Q92575 508 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ALAS1P13196 640 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SAMM50Q9Y512 469 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 TMEM150BA6NC51 233 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 UNC13DQ70J99 1090 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RDH13Q8NBN7 331 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MKL1Q969V6 931 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 KIF5CO60282 957 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RRAGAQ7L523 313 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PANX2Q96RD6 677 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ST7Q9NRC1 585 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 COL4A5P29400 1685 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 LTBP1Q14766 1721 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 NFIBO00712 420 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MIIPQ5JXC2 388 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PIM2Q9P1W9 311 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 BICDL2A1A5D9 508 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 RASSF10A6NK89 507 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ENTPD3O75355 529 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ARP10275 920 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 KIAA1328Q86T90 577 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 BANK1Q8NDB2 785 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 FAM151AQ8WW52 585 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 MTMR8Q96EF0 704 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 PDIA5Q14554 519 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-202ENST00000296343 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms