RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SMCO2A6NFE2 343 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 B4E1Z4 1266 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 RASSF9O75901 435 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 KRT1P04264 644 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 EPHB1P54762 984 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 GPBP1Q86WP2 473 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 NCAPG2Q86XI2 1143 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CCNYQ8ND76 341 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TRIM11Q96F44 468 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 BTBD6Q96KE9 485 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM161BQ96MY7 647 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 HACD3Q9P035 362 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SEPT3Q9UH03 358 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 IL16Q14005 1332 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 EP400Q96L91 3159 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 GOLGA8RI6L899 631 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 MYO1FO00160 1098 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 STXBP3O00186 592 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 MBD4O95243 580 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 LIG4P49917 911 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 KRT17Q04695 432 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 RUNX1T1Q06455 604 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SPARCL1Q14515 664 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 NEK8Q86SG6 692 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC103Q8IW40 242 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 OPTNQ96CV9 577 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ADA2Q9NZK5 511 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 H7C1D1 291 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC27A2O14975 620 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 IMPDH2P12268 514 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 FOSL2P15408 326 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TFCP2Q12800 502 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CASP8Q14790 479 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 KRT40Q6A162 431 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TPH2Q8IWU9 490 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CASP10Q92851 521 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TTC17Q96AE7 1141 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 GINM1Q9NU53 330 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SYBUQ9NX95 663 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 KRT87PA6NCN2 255 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 GRM8O00222 908 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 COPEO14579 308 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 NR1I2O75469 434 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 DLGAP3O95886 979 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 PYGMP11217 842 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 MAPK4P31152 587 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CLCN6P51797 869 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 MFAP3P55082 362 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 MECOMQ03112 1051 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 SLFNL1Q499Z3 407 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 AHI1Q8N157 1196 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2-201ENST00000274711 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms