RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE3CQ15386 1083 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 STX1AQ16623 288 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 DRC7Q8IY82 874 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKS1AQ92625 1134 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX11Q96FC9 970 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL18Q96ME1 805 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 IL23AQ9NPF7 189 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO10Q9NW15 660 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMARCE1-201ENST00000264640 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP54Q96N23 3096 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 USP34Q70CQ2 3546 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBBXA8MT70 800 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R2C6 588 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PRC1O43663 620 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FGBP02675 491 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CA3P07451 260 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FCER1AP12319 257 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 LIG1P18858 919 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC25BP30305 580 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 MCAMP43121 646 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL23P55773 120 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ALX1Q15699 326 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 WASF1Q92558 559 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-CQ95604 372 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG4CQ96DT6 458 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf76Q96K31 380 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM87BQ96K49 555 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PHOX2BQ99453 314 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP19Q99542 508 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TINF2Q9BSI4 451 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 COG5Q9UP83 839 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIOO75962 3097 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYM6O95789 1325 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SIP14410 1827 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQ27 194 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQ64 194 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQD8 194 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRG0 241 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 RCCD1A6NED2 376 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 BECN2A8MW95 431 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 GPAA1O43292 621 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCY6O43306 1168 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 NRDCO43847 1150 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF15O94989 841 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 YEATS4O95619 227 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 BAG3O95817 575 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ASGR1P07306 291 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAT2P19087 354 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCY1A2P33402 732 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ZAP70P43403 619 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ME1P48163 572 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK7P50613 346 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM29Q14134 588 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 COG2Q14746 738 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT2Q15019 361 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 STK38Q15208 465 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRED2Q7Z698 418 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.03□□□□□ -1.12
SMARCE1-201ENST00000264640 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.03□□□□□ -1.12
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