RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 TOP1MTQ969P6 601 aa14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 GPATCH3Q96I76 525 aa14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 YME1L1Q96TA2 773 aa14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.57□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 NCK2O43639 380 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 ORC4O43929 436 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 FGRP09769 529 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 RSPH10BP0C881 870 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF543Q08ER8 600 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 USH1GQ495M9 461 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 SERINC5Q86VE9 423 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 EDAQ92838 391 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 COL20A1Q9P218 1284 aa14.56□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 MBTPS2O43462 519 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 UPP2O95045 317 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 THPOP40225 353 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 PTPN5P54829 565 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 LAMC2Q13753 1193 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 STXBP2Q15833 593 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 CLUL1Q15846 466 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPTC7Q8NI37 304 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 IWS1Q96ST2 819 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 COL4A6Q14031 1691 aa14.55□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 SNHG28P0DPA3 235 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 HYAL1Q12794 435 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TCF15Q12870 199 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 VPS53Q5VIR6 699 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 RMDN3Q96TC7 470 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAF1Q9H063 256 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TECTAO75443 2155 aa14.54□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPFIA4O75335 1185 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00271P0C7V0 271 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNA4P22459 653 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 SEPT8Q92599 483 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 FSD1Q9BTV5 496 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 CPVLQ9H3G5 476 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TOMM22Q9NS69 142 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.53□□□□□ -0.08
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM221A6NGB7 291 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 M0R296 226 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 STXBP3O00186 592 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 GRM6O15303 877 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 TBX10O75333 385 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRRX2Q99811 253 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 DCTPP1Q9H773 170 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.52□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 RB1P06400 928 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 HOXC8P31273 242 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 CTNNB1P35222 781 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 BMPR1AP36894 532 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 PKN1Q16512 942 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL17RAQ96F46 866 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 TTC14Q96N46 770 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 DMDP11532 3685 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYO7AQ13402 2215 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 ABCB11O95342 1321 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01565O15544 149 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 RGS20O76081 388 aa14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1-201ENST00000264244 NR3C2P08235 984 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms