RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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ODC1-201ENST00000234111 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 STK4Q13043 487 aa23.34■■□□□ 1.33
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ODC1-201ENST00000234111 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.32■■□□□ 1.32
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ODC1-201ENST00000234111 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.32■■□□□ 1.32
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ODC1-201ENST00000234111 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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ODC1-201ENST00000234111 ALADP13716 330 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-201ENST00000234111 CABP4P57796 275 aa23.28■■□□□ 1.32
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