RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Efhd1Q9D4J1 240 aa16.03■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 AmfrQ9R049 643 aa16.03■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ltbp2O08999 1813 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mpp3O88910 568 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sh3d21Q7TSG5 549 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sdccag8Q80UF4 717 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ece2Q80Z60 881 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pcdha12Q91Y18 950 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tfr2Q9JKX3 798 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ggps1Q9WTN0 300 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Myh8P13542 1937 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cavin1O54724 392 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 GabpaQ00422 454 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cfap157Q0VFX2 523 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Spryd7Q3TFQ1 196 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem109Q3UBX0 243 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ppp1r1bQ60829 194 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ces4aQ8R0W5 563 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nudt12Q9DCN1 462 aa16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm7168A0AUV4 508 aa16.02■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Acot10Q32MW3 439 aa16.02■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Galnt15Q9D2N8 638 aa16.02■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eps15P42567 897 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ushbp1Q8R370 680 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc25a38Q91XD8 326 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 GclcP97494 637 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Stoml1Q8CI66 399 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif17Q99PW8 1038 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Usp31E9Q6Y8 1344 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cyp26b1Q811W2 512 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Anapc4Q91W96 807 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nudt5Q9JKX6 218 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pex11aQ9Z211 246 aa16.01■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Oip5A2AQ14 241 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Serpina16D3Z660 418 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn2r71L7N2D8 855 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgap6O54834 987 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pgk2P09041 417 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kcna3P16390 528 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lig1P37913 916 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Grm1P97772 1199 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Siah1bQ06985 282 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpatch11Q3UFS4 262 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ece1Q4PZA2 769 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp90Q61967 636 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cdc14aQ6GQT0 603 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hsdl1Q8BTX9 330 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttc27Q8CD92 847 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dnajc19Q9CQV7 116 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rexo5D3YW29 759 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 RdxP26043 583 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Naa35Q6PHQ8 725 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Apol10aQ8CCA5 318 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sucla2Q9Z2I9 463 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm5934D3Z4U6 212 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Itgb5O70309 798 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tnni3P48787 211 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 YdjcQ14BV6 310 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Antxr2Q6DFX2 487 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef25Q9CWR0 618 aa16■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Abcd1P48410 736 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cep126Q0VBV7 1103 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 4933427I04RikQ3V053 235 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Havcr2Q8VIM0 281 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Svs3aF2Z472 265 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Specc1Q5SXY1 1067 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Epha7Q61772 998 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mcph1Q7TT79 822 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Entpd3Q8BFW6 529 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nrbp2Q91V36 499 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccdc96Q9CR92 584 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 FibpQ9JI19 357 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vnn1Q9Z0K8 512 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Syt2P46097 422 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc16a10Q3U9N9 512 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nemp2Q8CB65 421 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kcnj11Q61743 390 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kcnk18Q6VV64 394 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim9Q8C7M3 817 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zcchc18Q8VD24 393 aa15.99■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm3095E9Q058 166 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rit2P70425 217 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Alpk1Q9CXB8 1231 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mipol1Q9D9F8 279 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Myh14Q6URW6 2000 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm3414Q3TNU4 584 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Igbp1Q61249 340 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf687Q9D2D7 1237 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pidd1Q9ERV7 915 aa15.98■□□□□ 0.15
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ano6Q6P9J9 911 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms