RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Filip1Q9CS72 1211 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apol7aB2RT54 418 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Psmc2P46471 433 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxc13P50207 328 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rit2P70425 217 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pank2Q3U4S0 443 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mrgprb1Q3UG61 350 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Camsap3Q80VC9 1252 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc17a8Q8BFU8 601 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hsdl1Q8BTX9 330 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GsdmeQ9Z2D3 512 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tanc1Q0VGY8 1856 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc2a13Q3UHK1 637 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mbtps2Q8CHX6 515 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ints4Q8CIM8 964 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnk13Q8R1P5 405 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BcamQ9R069 622 aa20.36■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SpibO35906 267 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GclcP97494 637 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SobpQ0P5V2 864 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pbxip1Q3TVI8 727 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trmt1Q3TX08 663 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kansl1lQ5DTI6 991 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpd2Q64521 727 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slu7Q8BHJ9 585 aa20.35■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dph1Q5NCQ5 438 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Islr2Q5RKR3 745 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddx19bQ8BZY3 494 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ildr1Q8CBR1 537 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MyocdQ8VIM5 935 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc27A2A6Q5 825 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hmgcs2P54869 508 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mcm6P97311 821 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ecm1Q61508 559 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Thap3Q8BJ25 218 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb12Q9Z150 459 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sbno2Q7TNB8 1349 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgra2Q91ZV8 1336 aa20.34■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rabgap1A2AWA9 1064 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cpb1B2RS76 415 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Morf4l1P60762 362 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pou2f2Q00196 463 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim9Q8C7M3 817 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nemp2Q8CB65 421 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Med24Q99K74 987 aa20.33■□□□□ 0.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AunipE9Q6Z5 340 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MyocO70624 490 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcna2P63141 499 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il6stQ00560 917 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trpc6Q61143 930 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxd1Q61345 456 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trak2Q6P9N8 913 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mrpl58Q8R035 206 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc25a38Q91XD8 326 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Elp3Q9CZX0 547 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mipol1Q9D9F8 279 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rbp7Q9EPC5 134 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Grin2dQ03391 1323 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 YdjcQ14BV6 310 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zkscan4Q5SZT6 480 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rusc1Q8BG26 893 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx32Q8BZS9 744 aa20.32■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nucb2P81117 420 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sox10Q04888 466 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep135Q6P5D4 1140 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ctu1Q99J10 420 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kremen1Q99N43 473 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf181Q9CY62 165 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdca7Q9D0M2 382 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PycardQ9EPB4 193 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh2b2Q9JID9 621 aa20.31■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TazI7HJS2 263 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Taf1bP97358 586 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnb1Q03717 857 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp13Q5BKP2 858 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Epha7Q61772 998 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Asic1Q6NXK8 526 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eps8l1Q8R5F8 716 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp9aO70228 1047 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lmntd2Q0VET5 664 aa20.3■□□□□ 0.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trappc3lQ4KL14 181 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.9 ms