RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa25.5■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mipol1Q9D9F8 279 aa25.5■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Erbb2P70424 1256 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fdxacb1Q3UY23 622 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nt5c2Q3V1L4 560 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dmtf1Q8CE22 761 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Appl2Q8K3G9 662 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrrc2Q8VDB8 371 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tas1r1Q99PG6 842 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcnh7Q9ER47 1195 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lama3Q61789 3330 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Capn2O08529 700 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kpna6O35345 536 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ddr2Q62371 854 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mtmr10Q7TPM9 771 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 DgkeQ9R1C6 564 aa25.48■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adamts9E9PUN6 1931 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Robo3Q9Z2I4 1366 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb21E9Q444 1094 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp9aO70228 1047 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Stat1P42225 749 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Meis1Q60954 390 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem132dQ76HP3 1097 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MylipQ8BM54 445 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ago4Q8CJF8 861 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Foxe3Q9QY14 288 aa25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cpb1B2RS76 415 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp27b1O35084 507 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppfia3P60469 1194 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gpatch11Q3UFS4 262 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Antxr2Q6DFX2 487 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aox1O54754 1333 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc15Q8C9M2 810 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Bcas3Q8CCN5 928 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rufy3Q9D394 469 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smco2Q9DA21 347 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa25.45■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc78D3Z5T1 437 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp3a25O09158 503 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PfkmP47857 780 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mgat3Q10470 538 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc27a1Q60714 646 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 GypcQ78HU7 95 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Iffo2Q8R2V2 512 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wasf1Q8R5H6 559 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc5a4aQ9ET37 656 aa25.44■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 EvcP57680 1005 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 DmwdQ08274 665 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tnni3kQ5GIG6 834 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ces1eQ64176 562 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gja6Q6S5G4 283 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Samm50Q8BGH2 469 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Oit3Q8R4V5 546 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mcoln1Q99J21 580 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Extl2Q9ES89 330 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lypla2Q9WTL7 231 aa25.43■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem240B2RWJ3 173 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem132bF7BAB2 1078 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sptlc1O35704 473 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01644 108 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01645 108 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01646 108 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P01647 108 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 ArP19091 899 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dpf3P58269 378 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fermt2Q8CIB5 680 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmco4Q91WU4 631 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trpm5Q9JJH7 1158 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gon4lQ9DB00 2260 aa25.42■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Baz2bA2AUY4 2123 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ctdnep1Q3TP92 244 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kmt5bQ3U8K7 883 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gas6Q61592 674 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NostrinQ6WKZ7 506 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P2ry10Q8BFU7 328 aa25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tbkbp1A2A9T0 611 aa25.4■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam124aD3Z5V4 536 aa25.4■■□□□ 1.66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hoxc8P09025 242 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.3 ms