RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmd2Q8VDM4 908 aa18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lpin2Q99PI5 893 aa18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Akr1b10G5E895 316 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Orc4O88708 433 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stat4P42228 749 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hps5P59438 1126 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stxbp3Q60770 592 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxd1Q61345 456 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc148Q6P5U8 527 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ParnQ8VDG3 624 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mzb1Q9D8I1 188 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mxra8Q9DBV4 442 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SyncQ9EPM5 470 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mkrn1Q9QXP6 481 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc26a4Q9R155 780 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubr3Q5U430 1889 aa18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MtrA6H5Y3 1253 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r78K7N6U5 853 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sap30bpQ02614 308 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam183bQ5NC57 135 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PodnQ7TQ62 611 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cog5Q8C0L8 829 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CoasyQ9DBL7 563 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem191cQ9JJB1 302 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col11a2Q64739 1736 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim30cD3YVI9 513 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eef2P58252 858 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbln1Q08879 705 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl20Q8VCK5 604 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbpl1aQ91XL9 950 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Golgb1E9PVZ8 3238 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700003F12RikA2AKE5 210 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsd17b1P51656 344 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdhd1P59328 1117 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Surf6P70279 355 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psd3Q2PFD7 1037 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sycp1Q62209 993 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AopepQ8BXQ6 817 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc13a4Q8BZ82 625 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata2Q8K004 515 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata17Q9D552 379 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppfibp2O35711 882 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bbof1Q3V079 533 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf207Q3V3A7 635 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GartQ64737 1010 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Creb3l3Q91XE9 479 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Haus2Q9CQS9 234 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Coro7Q9D2V7 922 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap1g2O88512 791 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fdx1P46656 188 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gjb6P70689 261 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsun7Q14AW5 724 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhdc9Q3USL1 350 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd1Q5M956 257 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tm4sf1Q64302 202 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx19bQ8BZY3 494 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Strip1Q8C079 837 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddah1Q9CWS0 285 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc89Q9DA73 370 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbx18Q9EPZ6 613 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh2b2Q9JID9 621 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex21Q9R0U9 575 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra10Q9R1G6 266 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb2b12S4R2L0 112 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighmbp2P40694 993 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stat3P42227 770 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra4Q60651 263 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp17leQ7M764 540 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbed3Q9D0L1 228 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nfu1Q9QZ23 255 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc24E9PUW8 296 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acsbg2Q2XU92 667 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5169Q5M8P2 212 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrit1Q8K099 624 aa18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 XlrP05531 208 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim43cP86449 446 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spocd1B1ASB6 936 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r79E9Q067 851 aa18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15 ms