RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	IMP2'	P32351	346 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HXT1	P32465	570 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	POA1	P38218	177 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YBR137W	P38276	179 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SHG1	P38337	142 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YBR285W	P38354	144 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NPR2	P39923	615 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VFA1	P40080	203 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MPS3	P47069	682 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MRX6	P48564	524 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SPT20	P50875	604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ERV14	P53173	138 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YTP1	P53584	459 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YML037C	Q03703	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TRM82	Q03774	444 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IMA2	Q08295	589 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	THI21	Q08975	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NSL1	Q12143	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MED1	Q12321	566 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YLR358C	O13565	187 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	COB	P00163	385 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HTB2	P02294	131 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	COX4	P04037	155 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TOP3	P13099	656 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SPO16	P17122	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SIR1	P21691	654 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HIR1	P32479	840 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SPO23	P33757	523 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YBR259W	P38338	688 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DUN1	P39009	513 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CIT3	P43635	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	GUF1	P46943	645 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SIP4	P46954	829 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YJR030C	P47101	745 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YJR154W	P47181	346 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HCH1	P53834	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	OCA2	P53949	197 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MET14	Q02196	202 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	FMN1	Q03778	218 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	DFG5	Q05031	458 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CDA2	Q06703	312 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RSB1	Q08417	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PIN2	Q12057	282 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YDL206W	Q12424	762 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MRPL44	P19956	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PTP2	P29461	750 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	LDS1	P31379	325 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	BET3	P36149	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	APN2	P38207	520 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	SCC4	P40090	624 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CFD1	P40558	293 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	HXT9	P40885	567 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MAD2	P40958	196 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MTQ1	P53944	314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YDC1	Q02896	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RMT2	Q03305	412 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MCH5	Q08777	521 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	GUP2	Q08929	609 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YPR202W	Q08993	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	BMT6	Q12291	365 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MTR10	Q99189	972 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	VTH1	P40438	1549 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	CIT1	P00890	479 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	IDI1	P15496	288 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	LAC1	P28496	418 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ARO7	P32178	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	MCM10	P32354	571 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EXO1	YOR033C	ERV46	P39727	415 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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