RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YHR214WP0CX19 203 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.17□□□□□ -2.06not detected
YMR001C-AYMR001C-A TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A ERP2P39704 215 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A BRO1P48582 844 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YKU80Q04437 629 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YEH1Q07804 573 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data2.17□□□□□ -2.06not detected
YMR001C-AYMR001C-A SSP2Q08646 371 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A FDH1Q08911 376 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A RAV1P47104 1357 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MID2P36027 376 aa2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YBR225WP38321 900 aa2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A VID30P53076 958 aa2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MTM1P53320 366 aa2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A HER2Q03557 464 aa2.16□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A NFT1P0CE68 1218 aa2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A SPS22P25380 463 aa2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A SSU1P41930 458 aa2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A PNG1Q02890 363 aa2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A VPS38Q05919 439 aa2.15□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A TRP1P00912 224 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YCR041WP37265 110 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A VID24P38263 362 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YBR137WP38276 179 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MST28P39552 234 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A SLG1P54867 378 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MRP51Q02950 344 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A HUA2Q12134 243 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A RAD61Q99359 647 aa2.14□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A GAL80P04387 435 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A ITR1P30605 584 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A LAM5P43560 674 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A PPM1Q04081 328 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MUM3Q08750 479 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A RRD2Q12461 358 aa2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CDC16P09798 840 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A NUP2P32499 720 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MUM2P38236 366 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A TPM2P40414 161 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A URB2P47108 1174 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MEP3P53390 489 aa2.12□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A PRD1P25375 712 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A WBP1P33767 430 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YJR008WP47085 338 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YIP1P53039 248 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A PCP1P53259 346 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A NMD4Q12129 218 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YPR022CQ12139 1133 aa2.11□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A SLY1P22213 666 aa2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A KKQ8P36004 724 aa2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A FLC2P39719 783 aa2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A FIN1Q03898 291 aa2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.1□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CYC3P06182 269 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CSE2P33308 149 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A CBP4P37267 147 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A THI2P38141 450 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A GAB1P41733 394 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A SOV1Q04748 898 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A TIM18Q08749 192 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A AHC1Q12433 566 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A AVL9Q12500 764 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A YJR112W-AQ3E743 109 aa2.09□□□□□ -2.07
YMR001C-AYMR001C-A ATP10P18496 279 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A PEP3P27801 918 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A FUI1P38196 639 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A REG2P38232 338 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YMR018WQ04364 514 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A IRC25Q07951 179 aa2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A POP5P28005 173 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A NPL6P32832 435 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A SSN8P47821 323 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YGL108CP53139 140 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MDG1P53885 366 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A DOT5P40553 215 aa2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A PET130P47065 347 aa2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MRX6P48564 524 aa2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms