RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	SPP2	Q02521	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NUP100	Q02629	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	UIP4	Q08926	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DIN7	Q12086	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NMD4	Q12129	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PCL9	Q12477	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SKN1	P33336	771 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SCD5	P34758	872 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RIM2	P38127	377 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ATG14	P38270	344 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RCK1	P38622	512 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FAA3	P39002	694 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SDP1	P40479	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FMC1	P40491	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MPS2	P53159	387 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ARP4	P80428	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ARP9	Q05123	467 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RSC6	P25632	483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PPZ1	P26570	692 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ATP11	P32453	318 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	GID8	P40208	455 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YJR030C	P47101	745 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	COG7	P53195	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MTM1	P53320	366 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SNF12	P53628	566 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VHS1	Q03785	461 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PLP1	Q04004	230 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	URK1	P27515	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PEP12	P32854	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SFC1	P33303	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MRPL17	P36528	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RCY1	P39531	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	UBP5	P39944	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	JLP2	P40206	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	AIM20	P40451	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YFL066C	P43538	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ATF2	P53296	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FMN1	Q03778	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RIM13	Q03792	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RAD30	Q04049	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YOS9	Q99220	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CDC4	P07834	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	UNG1	P12887	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNF4	P12904	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CLN1	P20437	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YKR051W	P36142	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MRPL36	P36531	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SLM1	P40485	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NUP85	P46673	744 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MDV1	P47025	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNX4	P47057	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	EAF1	Q06337	982 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ENT4	Q07872	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SGO1	Q08490	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PTP1	P25044	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	INM1	P38710	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	VPS52	P39904	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YIL166C	P40445	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MNT2	P53059	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNF8	Q12483	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	KIN3	P22209	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BEM3	P32873	1128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SLC1	P33333	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PPE1	P38796	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	OSW5	P40219	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	COG5	P53951	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YMD8	Q03697	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NAM2	P11325	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CAP2	P13517	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	UGA1	P17649	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SFP1	P32432	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms