RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YNL234W	P53857	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	EKI1	Q03764	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MDM30	Q05930	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	NDL1	Q06568	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	BUG1	Q12191	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	BEM1	P29366	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CSM2	P40465	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RTS2	P40962	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SEG1	Q04279	960 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	HSP31	Q04432	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	GLO2	Q05584	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	COQ11	Q05892	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	DIC1	Q06143	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	GSH2	Q08220	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RUP1	Q12242	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RHB1	P25378	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SPC110	P32380	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YEL043W	P32618	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SIF2	P38262	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YSW1	P38280	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ERG7	P38604	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MLH1	P38920	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	POP2	P39008	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PCL6	P40038	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	FAU1	P40099	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YTA12	P40341	825 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	FET5	P43561	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	GPI1	P53306	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YFH1	Q07540	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	THI20	Q08224	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	HER1	Q12276	1246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	HIF1	Q12373	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CYB2	P00175	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PMR1	P13586	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SMI1	P32566	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	RAD24	P32641	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MRPL4	P36517	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	CHS6	P40955	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SAS2	P40963	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SAM50	P53969	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SEC5	P89102	971 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SLD5	Q03406	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MGR3	Q04472	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	IVY1	Q04934	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	BNA5	Q05979	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PHO92	Q06390	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	DAP2	P18962	818 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	EXO70	P19658	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PEX2	P32800	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	VPS17	P32913	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PDR3	P33200	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	SCO2	P38072	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	FAD1	P38913	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	EPL1	P43572	832 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	YGL082W	P53155	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	DSL1	P53847	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	OCA2	P53949	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	MSS11	Q03825	758 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSD1	YGL196W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	STF1	P01098	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PDE2	P06776	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MIC60	P36112	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RRN10	P38204	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
DSD1	YGL196W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	IZH1	Q03419	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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