RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ARE1	P25628	610 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CSM1	P25651	190 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ETR1	P38071	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SHO1	P40073	367 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MSS2	P40990	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
DNF2	YDR093W	NSG2	P53898	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SLM2	P53955	656 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	FAB1	P34756	2278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GLN3	P18494	730 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AMS1	P22855	1083 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LNP1	P38878	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YER186C	P40101	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NDE1	P40215	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YJR098C	P47139	656 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PEX13	P80667	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MET14	Q02196	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MSF1	P08425	469 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MNN1	P39106	762 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SPP2	Q02521	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	BSC2	Q05611	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YCR099C	P25657	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YUR1	P26725	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RIB5	P38145	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YEN1	P40028	759 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NEO1	P40527	1151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ERR3	P42222	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GET1	P53192	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TRM12	Q04235	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RRG8	Q06109	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MLH3	Q12083	715 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SCM3	Q12334	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	COR1	P07256	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PRI2	P20457	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PEX2	P32800	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PEX6	P33760	1030 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ECM13	P38195	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YBR053C	P38235	358 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NEM1	P38757	446 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AIM18	P38884	321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RTS2	P40962	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
DNF2	YDR093W	CWP1	P28319	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MDL1	P33310	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AGP2	P38090	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CCT6	P39079	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LTP1	P40347	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AIM25	P47140	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	STR2	P47164	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PPT1	P53043	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	KSS1	P14681	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	EMP65	P40085	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SSY5	P47002	699 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MRH4	P53166	561 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	JAC1	P53193	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SHY1	P53266	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	BOP3	P53958	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MEH1	Q02205	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TDA1	Q03533	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ARP9	Q05123	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GIC2	Q06648	383 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	IRC25	Q07951	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RDR1	Q08904	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LRG1	P35688	1017 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SNX4	P47057	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MNT2	P53059	558 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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