RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 NDST4Q9H3R1 872 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PLAAQ9Y263 795 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 M0R2N6 131 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 FAM107AO95990 144 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 ZNF384Q8TF68 577 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 DONSONQ9NYP3 566 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SUFUQ9UMX1 484 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 USP17L12C9JPN9 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 USP17L21D6R901 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 FGRP09769 529 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SMTNP53814 917 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PIGBQ92521 554 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 NOX5Q96PH1 765 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CENPHQ9H3R5 247 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CEP83Q9Y592 693 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CHUKO15111 745 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 STARD3NLO95772 234 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 TXNRD1Q16881 649 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 COL4A1P02462 1669 aa22.65■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 HGSNATQ68CP4 663 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MCM8Q9UJA3 840 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 USP21Q9UK80 565 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CABP7Q86V35 215 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 A0A1B0GUL6 1792 aa22.64■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 BACH1O14867 736 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 RAD51CO43502 376 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CALML3P27482 149 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 QPCTQ16769 361 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 RREB1Q92766 1687 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CYP2D6P10635 497 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 DDB1Q16531 1140 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 PDXDC1Q6P996 788 aa22.62■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 CENPPQ6IPU0 288 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.61■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 KLRC1P26715 233 aa22.6■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 C21orf2O43822 256 aa22.6■■□□□ 1.21
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PMS1-222ENST00000639501 NEDD9Q14511 834 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 MAN2A1Q16706 1144 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 SUSD4Q5VX71 490 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 BARGINQ6ZT62 677 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 HSD17B3P37058 310 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 IQCDQ96DY2 449 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-222ENST00000639501 H0YGN5 161 aa22.59■■□□□ 1.21
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