RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625344.2

PROX1-AS1-223, PROX1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PROX1-AS1, Length 365 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	STXBP2	Q15833	593 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	STXBP3	O00186	592 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CDK7	P50613	346 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SP2	Q02086	613 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	BAD	Q92934	168 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PHKB	Q93100	1093 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	NID2	Q14112	1375 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PROX1-AS1-223	ENST00000625344		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ARVCF	O00192	962 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CLTB	P09497	229 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PSMA5	P28066	241 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CCND2	P30279	289 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	STK3	Q13188	491 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	NTRK3	Q16288	839 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MAF1	Q9H063	256 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344		Q9Y3F1	56 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ELP1	O95163	1332 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344		A6NJR5	290 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344		B4DLN1	442 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	GH1	P01241	217 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MMP3	P08254	477 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	EPHB4	P54760	987 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	NAPA	P54920	295 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PKN1	Q16512	942 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PTPRS	Q13332	1948 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	B4GALT4	O60513	344 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	LARGE1	O95461	756 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	GGPS1	O95749	300 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CD4	P01730	458 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CPT1A	P50416	773 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	RCAN1	P53805	252 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	EVC	P57679	992 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	TRAF1	Q13077	416 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	KAT2B	Q92831	832 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PROX1-AS1-223	ENST00000625344	CUL5	Q93034	780 aa		10.56	□□□□□ -0.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms