RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MNS1Q8NEH6 495 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR24Q96S15 920 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMD1Q99460 953 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC26A0AVF1 554 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 B4DLN1 442 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC63Q05C16 580 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OGFOD1Q8N543 542 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FANCGO15287 622 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MMP14P50281 582 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERVK-24P63145 666 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP4P98171 946 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DLGAP5Q15398 846 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ELF2Q15723 593 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNK18Q7Z418 384 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM151AQ8WW52 585 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HPS3Q969F9 1004 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC7Q99615 494 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBX3O15119 743 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP3K9P80192 1104 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ECM1Q16610 540 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIFC2Q96AC6 838 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQCDQ96DY2 449 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STK24Q9Y6E0 443 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JAG1P78504 1218 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EHHADHQ08426 723 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSG101Q99816 390 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCB11O95342 1321 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USH1GQ495M9 461 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q4G0T1 1027 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS33BQ9H267 617 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SREBF1P36956 1147 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNAP25P60880 206 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBXN4Q92575 508 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GJA10Q969M2 543 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GMLQ99445 158 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FEZ1Q99689 392 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PRG0 241 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMD14O00487 310 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD17O75943 681 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FIGNQ5HY92 759 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERMNQ8TAM6 284 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOPCQ9HD26 462 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PANK4Q9NVE7 773 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLRN2A0PK11 232 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLA2G4BP0C869 781 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAT2P52630 851 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRR16Q569H4 304 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIIPQ5JXC2 388 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM20AQ96MK3 541 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARID3AQ99856 593 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARD6Q9BX69 1037 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMX2Q9Y320 296 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COASYQ13057 564 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TUBB2AQ13885 445 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PQJ5 194 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIK3CDO00329 1044 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms