RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 CDKL5O76039 1030 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 RXRAP19793 462 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 STAT2P52630 851 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 ACVR2BQ13705 512 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC37A2A6NM11 1700 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-214ENST00000592483 KLRF2D3W0D1 207 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CPLX1O14810 134 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SCRN1Q12765 414 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 STK3Q13188 491 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD1Q719H9 257 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 HLA-CQ95604 372 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO28Q9NVF7 368 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM232C9JQI7 657 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RFXAPO00287 272 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY6O43306 1168 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 LARGE1O95461 756 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 FDX1P10109 184 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX11Q96FC9 970 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC27P30260 824 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NKX3-2P78367 333 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC144BQ3MJ40 725 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 REPS2Q8NFH8 660 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE5O15320 804 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNAR1P17181 557 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL23P55773 120 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX27Q96L92 541 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 MRE11P49959 708 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CUL4AQ13619 759 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBBXA8MT70 800 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR33A8MZF0 331 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CA3P07451 260 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NTRK3Q16288 839 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NECAB1Q8N987 351 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA2Q9UL42 364 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CABYRO75952 493 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 STK36Q9NRP7 1315 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FUT2Q10981 343 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT40Q6A162 431 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 VWCEQ96DN2 955 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CERS4Q9HA82 394 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 EPOPA6NHQ4 379 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ST3GAL1Q11201 340 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAF1Q13077 416 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGA7Q13683 1181 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KIFC2Q96AC6 838 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR8Q96EF0 704 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CD320Q9NPF0 282 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKMP08237 780 aa27.17■■□□□ 1.94
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