RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 CYP2C18P33260 490 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 PGM5Q15124 567 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 AFG1LQ8WV93 481 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.937e-7■□□□□ 8.5
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CTIF-209ENST00000591387 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.83■□□□□ 0.93
CTIF-209ENST00000591387 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.83■□□□□ 0.93
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CTIF-209ENST00000591387 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.82■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 KRT32Q14532 448 aa20.81■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 PPTC7Q8NI37 304 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 CUL5Q93034 780 aa20.8■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 HERVK_113Q902F9 699 aa20.79■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.78■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 PITPNM1O00562 1244 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 PFKMP08237 780 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 CYP2C9P11712 490 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 RXRAP19793 462 aa20.77■□□□□ 0.92
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CTIF-209ENST00000591387 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 KAT2BQ92831 832 aa20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTIF-209ENST00000591387 ICAM3P32942 547 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 RFC2P35250 354 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 BFSP2Q13515 415 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 APOA5Q6Q788 366 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 MICU3Q86XE3 530 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 RASEFQ8IZ41 740 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 RETREG2Q8NC44 543 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 GUCD1Q96NT3 240 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 NOD1Q9Y239 953 aa20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 MYO9BQ13459 2157 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 MEIS2O14770 477 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 GGPS1O95749 300 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 PTGISQ16647 500 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 KCNB2Q92953 911 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 FAM161BQ96MY7 647 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 SPATA33Q96N06 139 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.75■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 HAS3O00219 553 aa20.74■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 F2P00734 622 aa20.74■□□□□ 0.91
CTIF-209ENST00000591387 NEFLP07196 543 aa20.74■□□□□ 0.91
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