RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.3■■□□□ 1.32
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UBXN6-206ENST00000590466 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 IL17RAQ96F46 866 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-206ENST00000590466 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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UBXN6-206ENST00000590466 UBE2SQ16763 222 aa23.25■■□□□ 1.31
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UBXN6-206ENST00000590466 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 SMCO2A6NFE2 343 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-206ENST00000590466 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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