RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT6Q14141 434 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC24Q50LG9 513 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 JAMLQ86YT9 394 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP63Q96MT8 703 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIS3Q99687 375 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM8Q9UJA3 840 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMM50Q9Y512 469 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 COL4A5P29400 1685 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CILPO75339 1184 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 DDAH1O94760 285 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 IL1R1P14778 569 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL24Q5JXM2 366 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 DACT2Q5SW24 774 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 APBA2Q99767 749 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 HCN2Q9UL51 889 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TNNQ9UQP3 1299 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GTH6 734 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CREB3O43889 395 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CAND2O75155 1236 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CIAO1O76071 339 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHA1P01876 353 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP8B2P98198 1209 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATC1Q76KD6 591 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 REC114Q7Z4M0 266 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP8Q86W28 1048 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO27Q8NI29 283 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 COL4A1P02462 1669 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SHTN1A0MZ66 631 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 SRGAP3O43295 1099 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF4AO95239 1232 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 ATE1O95260 518 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PROCP04070 461 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 KLRK1P26718 216 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 MTX1Q13505 466 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PERM1Q5SV97 790 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PLD4Q96BZ4 506 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 OSMRQ99650 979 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PASKQ96RG2 1323 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PNR3 127 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 BNIP3LO60238 219 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 FGFR2P21802 821 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX18P35713 384 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 GYG1P46976 350 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 HTRA3P83110 453 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 NFKB2Q00653 900 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 CTBSQ01459 385 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms