RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM86B2P0C5J1 330 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2C8P10632 490 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP55Q53EZ4 464 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 NCAPG2Q86XI2 1143 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF22Q8N9C0 903 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 LENG9Q96B70 501 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR1Q96RJ0 339 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PXMP2Q9NR77 195 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR16Q569H4 304 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SPECC1Q5M775 1068 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD35Q8N283 1001 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 DNERQ8NFT8 737 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 HAS1Q92839 578 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN18Q99952 460 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MORF4L1Q9UBU8 362 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXNB2O15031 1838 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC3P19447 782 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TXKP42681 527 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF16Q5VV41 709 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CCSER1Q9C0I3 900 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TNMDQ9H2S6 317 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 USP25Q9UHP3 1055 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 BCRP11274 1271 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF445P59923 1031 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PGM5Q15124 567 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ETNPPLQ8TBG4 499 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD2LQ9BRP1 358 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA12Q9UN75 941 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC34Q96HJ3 373 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 EPSTI1Q96J88 318 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MXRA8Q9BRK3 442 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIS1O00470 390 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TECP42680 631 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SREBF2Q12772 1141 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 Q3C1V9 767 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 YY1P25490 414 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 UBA7P41226 1012 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 USP49Q70CQ1 688 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G4DQ86XP0 818 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IWS1Q96ST2 819 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 STAM2O75886 525 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 UBXN2AP68543 259 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 KANK3Q6NY19 840 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SDF4Q9BRK5 362 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 STK24Q9Y6E0 443 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A4O43511 780 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CCND2P30279 289 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM110CQ1W6H9 321 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LRWD1Q9UFC0 647 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC39Q9UFE4 941 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MSH4O15457 936 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX10O60683 326 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KRBA2Q6ZNG9 492 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCE3A1L190 88 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 B4DLN1 442 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIG10LQ86VR7 867 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IQUBQ8NA54 791 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 JADE2Q9NQC1 790 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEB2H3BUK9 544 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 NR3C2P08235 984 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD2Q14681 263 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CNNM3Q8NE01 707 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IL31RAQ8NI17 732 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2W1Q8TAV3 490 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC37A2A6NM11 1700 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.97■■■■□ 3.195e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MAFGO15525 162 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FCER1AP12319 257 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK4Q16566 473 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNL1Q8IU54 200 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A5Q92911 643 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LRSAM1Q6UWE0 723 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CABP7Q86V35 215 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM133AQ8N9E0 248 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP19Q99542 508 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGB5P18084 799 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TM4SF4P48230 202 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LONRF3Q496Y0 759 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ABRAQ8N0Z2 381 aa34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms