RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 AKR1B1P15121 316 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD7Q9P203 1132 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-204ENST00000587718 RPTORQ8N122 1335 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC17Q96LX7 622 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.72■■■□□ 2.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.72■■■□□ 2.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCRHP07919 91 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 OGDHLQ9ULD0 1010 aa28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 DSG3P32926 999 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPHP41219 470 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC112Q8NEF3 446 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2D4AQ9H788 454 aa28.66■■■□□ 2.18
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