RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CDC25BP30305 580 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ANGPT1Q15389 498 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 METTL24Q5JXM2 366 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RPAINQ86UA6 219 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BICD2Q8TD16 824 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BRF1Q92994 677 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 XAGE2Q96GT9 111 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 HINFPQ9BQA5 517 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MRIQ9BWK5 157 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SCN5AQ14524 2016 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TBX10O75333 385 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PDE8BO95263 885 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 LARGE1O95461 756 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TUBB4AP04350 444 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF9P0C862 333 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RESTQ13127 1097 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 STX1AQ16623 288 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PTPN21Q16825 1174 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BANK1Q8NDB2 785 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ADAM32Q8TC27 787 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RTKNQ9BST9 563 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KRT23Q9C075 422 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ANO10Q9NW15 660 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MYH3P11055 1940 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 NID2Q14112 1375 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 LINC01553A4QN01 128 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KALRNO60229 2985 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ITGA6P23229 1130 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ADORA2AP29274 412 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ICAM3P32942 547 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 GYG1P46976 350 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SHC2P98077 582 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 WDR78Q5VTH9 848 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SARM1Q6SZW1 724 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 STK36Q9NRP7 1315 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FAM196BA6NMK8 535 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 DYNC1I1O14576 645 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SEMA3EO15041 775 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ADCY5O95622 1261 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SDHBP21912 280 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ADD2P35612 726 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 LIFRP42702 1097 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TYRO3Q06418 890 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ST3GAL1Q11201 340 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SCRN1Q12765 414 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 MTMR2Q13614 643 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TRIM29Q14134 588 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TTC6Q86TZ1 520 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 CERS3Q8IU89 383 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 NECAB1Q8N987 351 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-218ENST00000584243 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms