RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 MFSD4AQ8N468 514 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FIBCD1Q8N539 461 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 EXOC2Q96KP1 924 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 POGKQ9P215 609 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 USP32Q8NFA0 1604 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 E9PCH4 1651 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PLD2O14939 933 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PRODHO43272 600 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 RFPL3O75679 317 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PROCP04070 461 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FGFR1P11362 822 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FSTP19883 344 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 AMPD3Q01432 767 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DOC2BQ14184 412 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NSMFQ6X4W1 530 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 HDAC8Q9BY41 377 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CHST7Q9NS84 486 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 KIF1AQ12756 1690 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 WDR64B1ANS9 1081 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GSC2O15499 205 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRM-208ENST00000578600 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CTSKP43235 329 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GRB10Q13322 594 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2R5DQ14738 602 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 OSBP2Q969R2 916 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 STK32BQ9NY57 414 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH1O95259 989 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 TM4SF20Q53R12 229 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 MTFR1LQ9H019 292 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ATG3Q9NT62 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 H0Y8X5 98 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GSNP06396 782 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SOX5P35711 763 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CYP4F3Q08477 520 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SLC51AQ86UW1 340 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SYT17Q9BSW7 474 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 IER2Q9BTL4 223 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PRR19A6NJB7 356 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DLX3O60479 287 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 VAMP4O75379 141 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SCG5P05408 212 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 CEACAM5P06731 702 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GFRA1P56159 465 aa7.28□□□□□ -1.24
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