RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.52■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.52■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 KAT2BQ92831 832 aa29.52■■■□□ 2.32
SPNS1-209ENST00000567771 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 RGS20O76081 388 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 PGM5Q15124 567 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 IL31RAQ8NI17 732 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 VSIG10LQ86VR7 867 aa29.49■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 LY9Q9HBG7 655 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 NOD1Q9Y239 953 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 A0A0C4DFX4 3053 aa29.48■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.48■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.48■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 IQCF3P0C7M6 154 aa29.47■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 PRC1O43663 620 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 BFSP2Q13515 415 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 CASC1Q6TDU7 716 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 SESTD1Q86VW0 696 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 PPTC7Q8NI37 304 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 MAP3K14Q99558 947 aa29.46■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 SLC27A2O14975 620 aa29.45■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 DDAH1O94760 285 aa29.45■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 RFC2P35250 354 aa29.45■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 RABGGTBP53611 331 aa29.45■■■□□ 2.31
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SPNS1-209ENST00000567771 MTA3Q9BTC8 594 aa29.45■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.45■■■□□ 2.31
SPNS1-209ENST00000567771 PSEN2P49810 448 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 SP2Q02086 613 aa29.44■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 SKAP1Q86WV1 359 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 EYSQ5T1H1 3165 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 MCM5P33992 734 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.43■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa29.43■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 MYOGP15173 224 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
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SPNS1-209ENST00000567771 NECTIN1Q15223 517 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA33Q96N06 139 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 KATNAL1Q9BW62 490 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 GBF1Q92538 1859 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 MYH7BA7E2Y1 1941 aa29.41■■■□□ 2.3
SPNS1-209ENST00000567771 TGFB3P10600 412 aa29.41■■■□□ 2.3
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