RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 CYBAP13498 195 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP4P98171 946 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ACVR2BQ13705 512 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 BECN1Q14457 450 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 BICD2Q8TD16 824 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 TNFRSF25Q93038 417 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ARIH2O95376 493 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 NBR1Q14596 966 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 GJA10Q969M2 543 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB5P18084 799 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 AP3B2Q13367 1082 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 STXBP2Q15833 593 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 COPS5Q92905 334 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FAM86B1E9PN63 330 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF333Q96JL9 665 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 TDP2O95551 362 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CCND2P30279 289 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SREBF1P36956 1147 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 LY6KQ17RY6 165 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 RNF208Q9H0X6 261 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CCL5P13501 91 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 LETM2Q2VYF4 491 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MORC4Q8TE76 937 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 KIF3AQ9Y496 699 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 IWS1Q96ST2 819 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SP2Q02086 613 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SEMA3FQ13275 785 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 GALNT17Q6IS24 598 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SMPD1P17405 629 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF76P36508 570 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 DEFB118Q96PH6 123 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MTMR6Q9Y217 621 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ARP10275 920 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 PRR16Q569H4 304 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 STX6O43752 255 aa24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ATP9AO75110 1047 aa24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 POTEFA5A3E0 1075 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SLC37A4O43826 429 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 PGK1P00558 417 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 SP4Q02446 784 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 ARMC5Q96C12 935 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-212ENST00000561293 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 VTA1Q9NP79 307 aa24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MYADML2A6NDP7 307 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 CEP55Q53EZ4 464 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TNS4Q8IZW8 715 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TNFAIP2Q03169 654 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MTMR1Q13613 665 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 NEK8Q86SG6 692 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 LENG9Q96B70 501 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms