RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 IMPDH2P12268 514 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ITGA4P13612 1032 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF28P17035 718 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ATP2B1P20020 1258 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 MCM4P33991 863 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SELENOPP49908 381 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SOGA3Q5TF21 947 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 NKD1Q969G9 470 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CAPN10Q9HC96 672 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 GULP1Q9UBP9 304 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 NTRK1P04629 796 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 WHRNQ9P202 907 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 C7orf72A4D263 438 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 PPP2CBP62714 309 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 PPP2CAP67775 309 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ARID5AQ03989 594 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ADAM9Q13443 819 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SGSM2O43147 1006 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SLC6A11P48066 632 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 TCEAL1Q15170 157 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SLFN13Q68D06 897 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF575Q86XF7 245 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 VPS37DQ86XT2 251 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.41□□□□□ -1.54
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TMOD3-202ENST00000558300 GRB10Q13322 594 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CR1LQ2VPA4 569 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 AMER2Q8N7J2 671 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 DPF3Q92784 378 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 DEF6Q9H4E7 631 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.4□□□□□ -1.54
TMOD3-202ENST00000558300 TLDC2A0PJX2 215 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 STXBP3O00186 592 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 NPHS1O60500 1241 aa5.39□□□□□ -1.55
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TMOD3-202ENST00000558300 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
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TMOD3-202ENST00000558300 TGFB2P61812 414 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 MIIPQ5JXC2 388 aa5.39□□□□□ -1.55
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TMOD3-202ENST00000558300 PALM2Q8IXS6 379 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 Q8TCH9 128 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 SEC14L1Q92503 715 aa5.39□□□□□ -1.55
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TMOD3-202ENST00000558300 GGT7Q9UJ14 662 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.38□□□□□ -1.55
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TMOD3-202ENST00000558300 PPP2R5DQ14738 602 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD3-202ENST00000558300 STK32CQ86UX6 486 aa5.38□□□□□ -1.55
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