RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, human

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM260-208	ENST00000555905	PGM5	Q15124	567 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PTPA	Q15257	358 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	RNF186	Q9NXI6	227 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	LCT	P09848	1927 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MARCH6	O60337	910 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PPP6R2	O75170	966 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TRPA1	O75762	1119 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TDP2	O95551	362 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TBC1D8	O95759	1140 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PGK2	P07205	417 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	NR3C2	P08235	984 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PTPRE	P23469	700 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ADORA2A	P29274	412 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CIITA	P33076	1130 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CNTN2	Q02246	1040 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CALCRL	Q16602	461 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MGAM	O43451	1857 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	EDIL3	O43854	480 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	STAM2	O75886	525 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	FCGRT	P55899	365 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PDE4D	Q08499	809 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	GRB14	Q14449	540 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	KIF22	Q14807	665 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905		Q4G0T1	1027 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PRR16	Q569H4	304 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	FERMT2	Q96AC1	680 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ASB14	A6NK59	587 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC37A4	O43826	429 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	GABBR2	O75899	941 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PRPH	P41219	470 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	UBE2H	P62256	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SP3	Q02447	781 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	STXBP2	Q15833	593 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MEIS1	O00470	390 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TBX3	O15119	743 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CUTA	O60888	179 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	COBL	O75128	1261 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	MORN1	Q5T089	497 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ADAL	Q6DHV7	355 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TMEM260-208	ENST00000555905	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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