RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	HSD17B4	P51659	736 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRDN	Q13061	729 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	BFSP2	Q13515	415 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTGIS	Q16647	500 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	KAT2B	Q92831	832 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	ACTN1	P12814	892 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	RFC2	P35250	354 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTH1R	Q03431	593 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP21A2	P08686	494 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHML	P26374	656 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	GHRHR	Q02643	423 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	DGKD	Q16760	1214 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	SESTD1	Q86VW0	696 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PPP4R4-204	ENST00000555690	LAMC2	Q13753	1193 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRM4	Q14833	912 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	PIGS	Q96S52	555 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERICH2	A1L162	156 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	RGS20	O76081	388 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	CAGE1	Q8TC20	777 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TET1	Q8NFU7	2136 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	CA3	P07451	260 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSEN2	P49810	448 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC9A7	Q96T83	725 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690		E7EWF7	191 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SORBS3	O60504	671 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	PGM5	Q15124	567 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	NCOA7	Q8NI08	942 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	IL31RA	Q8NI17	732 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	MUC3A	Q02505	3323 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYTH3	O43739	400 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TROAP	Q12815	778 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	MFSD10	Q14728	455 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPNMB	Q14956	572 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	WTAP	Q15007	396 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SGSM2	O43147	1006 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SELP	P16109	830 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRAF1	Q13077	416 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	CERS4	Q9HA82	394 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	THEG	Q9P2T0	379 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	RFXAP	O00287	272 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	F2	P00734	622 aa		28.32	■■■□□ 2.12

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