RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 BTDP43251 543 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CNGA3Q16281 694 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 MEIS3Q99687 375 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM122AQ96E09 287 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SH3GL2Q99962 352 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 POTEFA5A3E0 1075 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SYCE1LA8MT33 242 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 STX10O60499 249 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ6P48051 423 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 BCAMP50895 628 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ATL3Q6DD88 541 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ABI1Q8IZP0 508 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PLVAPQ9BX97 442 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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