RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.01□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.01□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.01□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.01□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 C8BP07358 591 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 GJA9P57773 515 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 RTP5Q14D33 572 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 SV2CQ496J9 727 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC103Q8IW40 242 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TEX2Q8IWB9 1127 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 BORCS6Q96GS4 357 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 LNPKQ9C0E8 428 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 FGRP09769 529 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TCF3P15923 654 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 SPATS1Q496A3 300 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 UBXN11Q5T124 520 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TTLL6Q8N841 843 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 KYQ8NBH2 561 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 DDX11Q96FC9 970 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.99□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 H7BY64 318 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ARNTLO00327 626 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TBX1O43435 398 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 DDAH1O94760 285 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ADRB1P08588 477 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 THBS2P35442 1172 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 LTBRP36941 435 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 ETFBP38117 255 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 GFRA1P56159 465 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 PLP2Q04941 152 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 CHRNA2Q15822 529 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP68Q76N32 757 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM169Q96HH4 297 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 BDH2Q9BUT1 245 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 NFKB2Q00653 900 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 NLRP10Q86W26 655 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 LGR4Q9BXB1 951 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 BTG4Q9NY30 223 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 PALD1Q9ULE6 856 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.97□□□□□ -1.13
GNPTAB-208ENST00000550718 B2RBV5 119 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 FPR2P25090 351 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 BCL6P41182 706 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 ARID5AQ03989 594 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 EMC4Q5J8M3 183 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 C1orf159Q96HA4 380 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 AGRPO00253 132 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 ECI1P42126 302 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 KRTAP10-2P60368 255 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 LSAMPQ13449 338 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 TINF2Q9BSI4 451 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.95□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 ITGA1P56199 1179 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 MAP4K2Q12851 820 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 PRR31Q5SQ13 230 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 GMLQ99445 158 aa7.94□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 K7ESM1 405 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 TADA3O75528 432 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 GJB6O95452 261 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 NKX3-2P78367 333 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 JAG2Q9Y219 1238 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.93□□□□□ -1.14
GNPTAB-208ENST00000550718 CNR2P34972 360 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms