RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMCX2Q7L311 632 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 CD320Q9NPF0 282 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 B4GALT4O60513 344 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 CDKL5O76039 1030 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 TTLL4Q14679 1199 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 SCLYQ96I15 445 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 FGD4Q96M96 766 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 KATNBL1Q9H079 304 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 GRIN2DO15399 1336 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 ERICH2A1L162 156 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L12C9JPN9 530 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L21D6R901 530 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP2A1O14983 1001 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 INCENPQ9NQS7 918 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-204ENST00000548823 H3BQV1 296 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CPLX1O14810 134 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB43O43298 467 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD21O60216 631 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CDK8P49336 464 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.266e-7■■□□□ 12.8
CTDSP2-204ENST00000548823 TNFAIP2Q03169 654 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 RESTQ13127 1097 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R5BQ15173 497 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ASTN1O14525 1302 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC69A6NI79 296 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT85P78386 507 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 TAP1Q03518 808 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 WTAPQ15007 396 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GPT2Q8TD30 523 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9A7Q96T83 725 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 FSD2A1L4K1 749 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ZEB2O60315 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GRB10Q13322 594 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SEC23AQ15436 765 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ATL3Q6DD88 541 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 TOMM22Q9NS69 142 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO40Q9UH90 709 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ACTN1P12814 892 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 UBE2HP62256 183 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 TLK2Q86UE8 772 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CPXCR1Q8N123 301 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 STK36Q9NRP7 1315 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF28PB7ZC32 967 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 NHLH1Q02575 133 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE4BQ07343 736 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 C12orf60Q5U649 245 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 MYH6P13533 1939 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 LPXNO60711 386 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 DTNBO60941 627 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED4O75132 1171 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF15O94989 841 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF445P59923 1031 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 NTRK3Q16288 839 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 IQCA1Q86XH1 822 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 GJD3Q8N144 294 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CHST13Q8NET6 341 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNH6Q9H252 994 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SENP2Q9HC62 589 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-204ENST00000548823 SCN5AQ14524 2016 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms