RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNT10BO00744 389 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB43O43298 467 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDKL5O76039 1030 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGRP09769 529 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLCD1P51178 756 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNB3P54284 484 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAS6Q14393 721 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP2R5BQ15173 497 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSRNP1Q96S65 589 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KAT14Q9H8E8 782 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INCENPQ9NQS7 918 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.51□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LGR5O75473 907 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRELPP51888 382 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUCB2P80303 420 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFIAQ12857 509 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CUL4AQ13619 759 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYBPC2Q14324 1141 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF15Q66K64 600 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP8Q86W28 1048 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HACL1Q9UJ83 578 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF24Q9UPV7 400 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNKSO95271 1327 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PNR3 127 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLTPD2A6NH11 291 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MARCH6O60337 910 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PFKFB2O60825 505 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDCP20941 246 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGFBP4P22692 258 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF5BP33176 963 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANTXR2P58335 489 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ME3Q16798 604 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DGKHQ86XP1 1220 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF3C6Q969F1 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LY9Q9HBG7 655 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STX8Q9UNK0 236 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPME1Q9Y570 386 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.5□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDAH1O94760 285 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VAMP1P23763 118 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NF2P35240 595 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPS15P42566 896 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNAQP50148 359 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RCAN1P53805 252 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP2B2Q01814 1243 aa6.49□□□□□ -1.37
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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