RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535819.1

TM7SF3-205, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-205ENST00000535819 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-205ENST00000535819 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-205ENST00000535819 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-205ENST00000535819 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.14■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 LAMA3Q16787 3333 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 ZBTB43O43298 467 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 TGFB3P10600 412 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 LY6KQ17RY6 165 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 MFSD5Q6N075 450 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 PSMA5P28066 241 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 FGD1P98174 961 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 FPGSQ05932 587 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 ARHGAP1Q07960 439 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 LAMC2Q13753 1193 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 FBXL16Q8N461 479 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 PSMC6P62333 389 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 RTN1Q16799 776 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 RGS20O76081 388 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 LRCH3Q96II8 777 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 MEIS2O14770 477 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 MMP3P08254 477 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 GNPTABQ3T906 1256 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 TMEM199Q8N511 208 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 AFG1LQ8WV93 481 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SZT2Q5T011 3432 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 SHHQ15465 462 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 DGKDQ16760 1214 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 IL31RAQ8NI17 732 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-205ENST00000535819 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 B4GALT4O60513 344 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 Q6ZUG5 572 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 PPTC7Q8NI37 304 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 RPS6KB1P23443 525 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 ICAM3P32942 547 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 HIPK3Q9H422 1215 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 FUT2Q10981 343 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 PPFIA4O75335 1185 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 USP26Q9BXU7 913 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 CPA1P15085 419 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 EPHB4P54760 987 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 SESTD1Q86VW0 696 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 BRF1Q92994 677 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 NID2Q14112 1375 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 FIBPO43427 364 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 GGPS1O95749 300 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 CDC27P30260 824 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 APOBRQ0VD83 1088 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-205ENST00000535819 NEDD9Q14511 834 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms