RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CYP2C9	P11712	490 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	GUCD1	Q96NT3	240 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	MMP3	P08254	477 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	PGM5	Q15124	567 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF20	Q5VTR2	975 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNAQ	P50148	359 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	FGB	P02675	491 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CALM1	P0DP23	149 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CALM2	P0DP24	149 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CALM3	P0DP25	149 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	RXRA	P19793	462 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCND2	P30279	289 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCLY	Q96I15	445 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	NOD1	Q9Y239	953 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	LIFR	P42702	1097 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	LAMC2	Q13753	1193 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	DGKD	Q16760	1214 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL31RA	Q8NI17	732 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SORBS3	O60504	671 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDC45	O75419	566 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	RGS20	O76081	388 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYH6	P13533	1939 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	DNAJB2	P25686	324 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	RASIP1	Q5U651	963 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	HERVK_113	Q902F9	699 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CUL5	Q93034	780 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEK1	Q96PY6	1258 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	RETREG2	Q8NC44	543 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	KAT2B	Q92831	832 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	GGPS1	O95749	300 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTGIS	Q16647	500 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPATA33	Q96N06	139 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	TGFB3	P10600	412 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSEN2	P49810	448 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	SP2	Q02086	613 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	BFSP2	Q13515	415 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYLIP	Q8WY64	445 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZBBX	A8MT70	800 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	DLL1	O00548	723 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	PBX2	P40425	430 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPRJ-206	ENST00000534219	RASEF	Q8IZ41	740 aa		28.75	■■■□□ 2.19

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