RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 GUCY1A2P33402 732 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 FGD1P98174 961 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 FSTL1Q12841 308 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 WTAPQ15007 396 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.16□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.16□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.15□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 CAP2P40123 477 aa7.15□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.15□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 NECAB1Q8N987 351 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 MKL1Q969V6 931 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 HOOK2Q96ED9 719 aa7.15□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 BTBD6Q96KE9 485 aa7.15□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 NID2Q14112 1375 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.15□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC69A6NI79 296 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 ADM5C9JUS6 153 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 ZBTB43O43298 467 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 CTDNEP1O95476 244 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 DOCK1Q14185 1865 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 GTF3C6Q969F1 213 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 CEP63Q96MT8 703 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 MAP3K14Q99558 947 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 BRD7Q9NPI1 651 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 GINM1Q9NU53 330 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 NYAP2Q9P242 653 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.14□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.13□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 DDAH1O94760 285 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 TTLL1O95922 423 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 CALM1P0DP23 149 aa7.13□□□□□ -1.27
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CMTM1-220ENST00000534143 CALM3P0DP25 149 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 RXRAP19793 462 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 CDC27P30260 824 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 INPP5BP32019 993 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-220ENST00000534143 DDIT3P35638 169 aa7.13□□□□□ -1.27
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