RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529048.5

TSTA3-209, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-209ENST00000529048 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MEIS2O14770 477 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PGM5Q15124 567 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PPP2R5BQ15173 497 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 LY6KQ17RY6 165 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CUL5Q93034 780 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 IWS1Q96ST2 819 aa16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CEP290O15078 2479 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NAPAP54920 295 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NBR1Q14596 966 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 FBXL16Q8N461 479 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SCFD2Q8WU76 684 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MAF1Q9H063 256 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PSTPIP2Q9H939 334 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 STARD7Q9NQZ5 370 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 STXBP3O00186 592 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MYL3P08590 195 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CCND2P30279 289 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 RCAN1P53805 252 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PSMC6P62333 389 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 TTLL4Q14679 1199 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 ANKRD1Q15327 319 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PGBD1Q96JS3 809 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.99■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 RGS20O76081 388 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 AK2P54819 239 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NUCB2P80303 420 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NTRK3Q16288 839 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NID2Q14112 1375 aa15.98■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 ADAMTS3O15072 1205 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 EVCP57679 992 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 CHMP4BP1P59074 171 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 TLE2Q04725 743 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SNX17Q15036 470 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PKN1Q16512 942 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 TMEM260Q9NX78 707 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.97■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SMCO2A6NFE2 343 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PIK3CDO00329 1044 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 SCG2P13521 617 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 NKX3-2P78367 333 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 ARHGAP1Q07960 439 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 AFG1LQ8WV93 481 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 BARHL2Q9NY43 387 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 Q9Y3F1 56 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.96■□□□□ 0.15
TSTA3-209ENST00000529048 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 ZEB2O60315 1214 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 LARGE1O95461 756 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 GH1P01241 217 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 ADCY7P51828 1080 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 SP2Q02086 613 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 SCRN1Q12765 414 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 GBP4Q96PP9 640 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 LTBP2Q14767 1821 aa15.95■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 GRIN2DO15399 1336 aa15.94■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.94■□□□□ 0.14
TSTA3-209ENST00000529048 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms