RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 WASH4PA8MWX3 477 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PLSCR1O15162 318 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF165P49910 485 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PDE4BQ07343 736 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.76□□□□□ -1.49
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HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ATG4CQ96DT6 458 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA32Q96LK8 384 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 LNPKQ9C0E8 428 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PLCG1P19174 1290 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SERINC3Q13530 473 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 DDB1Q16531 1140 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 GAB4Q2WGN9 574 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 UBXN4Q92575 508 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 KCNN1Q92952 543 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PIF1Q9H611 641 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3C2AO00443 1686 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 RREB1Q92766 1687 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SRFP11831 508 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TMF1P82094 1093 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 DPH6Q7L8W6 267 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ARMC5Q96C12 935 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SLC9A7Q96T83 725 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SP110Q9HB58 689 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TNS2Q63HR2 1409 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PQH9 124 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC5O00471 708 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 EGR3Q06889 387 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 LILRA2Q8N149 483 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 RNF32Q9H0A6 362 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP13Q9UII6 198 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC37A3O60309 1634 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 NFAT5O94916 1531 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 NCANO14594 1321 aa5.73□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 B8ZZF3 427 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PRRG2O14669 202 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 UBOX5O94941 541 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00310P59036 64 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ARSHQ5FYA8 562 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 OXR1Q8N573 874 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 COG3Q96JB2 828 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 GMIPQ9P107 970 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL3Q9UH77 587 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 COL18A1P39060 1754 aa5.72□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.71□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 PEAK1Q9H792 1746 aa5.71□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 NSD2O96028 1365 aa5.71□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 LTN1O94822 1766 aa5.71□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.71□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 B2RBV5 119 aa5.71□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF10CO14798 259 aa5.71□□□□□ -1.5
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