RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 CTAGE5O15320 804 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 RGS20O76081 388 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ARIH2O95376 493 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 PGK1P00558 417 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 COL6A1P12109 1028 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 LRRC41Q15345 812 aa18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ESYT2A0FGR8 921 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 SMCO2A6NFE2 343 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ADCY7P51828 1080 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 TNFAIP2Q03169 654 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 LRIT3Q3SXY7 679 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 VSIG10LQ86VR7 867 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 CUL5Q93034 780 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 STK36Q9NRP7 1315 aa18.96■□□□□ 0.63
HACE1-211ENST00000521962 B4DLN1 442 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DNM1LO00429 736 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DEXIO95424 95 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 NKX3-2P78367 333 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 STXBP2Q15833 593 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 PGBD1Q96JS3 809 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TMEM260Q9NX78 707 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CDH23Q9H251 3354 aa18.95■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 GJA9P57773 515 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 NPY5RQ15761 445 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TLK2Q86UE8 772 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SCFD2Q8WU76 684 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 COPS5Q92905 334 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.94■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 JAK2O60674 1132 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CDKL5O76039 1030 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCND2P30279 289 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 ANO3Q9BYT9 981 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 PCDHA6Q9UN73 950 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.93■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SEMA3FQ13275 785 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TDHQ8IZJ6 230 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 ARRDC4Q8NCT1 418 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 PHF24Q9UPV7 400 aa18.92■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 SYN1P17600 705 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 BEX3Q00994 111 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 AP3B2Q13367 1082 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 RNF180Q86T96 592 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DEFB123Q8N688 67 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 Q9Y3F1 56 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.91■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 KBTBD13C9JR72 458 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 TTLL4Q14679 1199 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 LY6KQ17RY6 165 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 Q7L0L9 218 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 C6orf50Q9HD87 102 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.9■□□□□ 0.62
HACE1-211ENST00000521962 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms