RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PDE4DQ08499 809 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TCF15Q12870 199 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 COL19A1Q14993 1142 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PKN1Q16512 942 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 KCTD1Q719H9 257 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 SCFD2Q8WU76 684 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM221A6NGB7 291 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 H3BNC9 293 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 M0R296 226 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PLA2G6O60733 806 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 AMHP03971 560 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TSPY3P0CV98 308 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TSPY8P0CW00 308 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 RBL2Q08999 1139 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 CLUL1Q15846 466 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 RPAINQ86UA6 219 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 SESTD1Q86VW0 696 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 CACNA1HO95180 2353 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 NCK2O43639 380 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 ICAM1P05362 532 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PDE4BQ07343 736 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBED1-205ENST00000515319 NFIBO00712 420 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MX1P20591 662 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 CALML3P27482 149 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 LTBRP36941 435 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TDO2P48775 406 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 NUCB1Q02818 461 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 STXBP3O00186 592 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MBTPS2O43462 519 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 LGR5O75473 907 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 SLC30A10Q6XR72 485 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM192Q8IY95 271 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 AFG1LQ8WV93 481 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 YME1L1Q96TA2 773 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MMP3P08254 477 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TFAP4Q01664 338 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 FBXO11Q86XK2 927 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 C7orf31Q8N865 590 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 LNPKQ9C0E8 428 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MTMR7Q9Y216 660 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 ARIH2O95376 493 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 APPP05067 770 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 PTK7Q13308 1070 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MBTPS1Q14703 1052 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 RASGRP2Q7LDG7 609 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 FBXL6Q8N531 539 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 KAT2BQ92831 832 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 STX8Q9UNK0 236 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 EMSYQ7Z589 1322 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 B4DLN1 442 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC96Q2M329 555 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 ALG1Q9BT22 464 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-205ENST00000515319 UPP2O95045 317 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms