RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 FERMT2Q96AC1 680 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 C6orf50Q9HD87 102 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 DEXIO95424 95 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 GNA11P29992 359 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ACLYP53396 1101 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 NKX3-2P78367 333 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 GNPTABQ3T906 1256 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 IL31RAQ8NI17 732 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ESYT2A0FGR8 921 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 MYADML2A6NDP7 307 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 BEX3Q00994 111 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 A0A1W2PQY0 241 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ASGR1P07306 291 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 TGFB3P10600 412 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CPT1AP50416 773 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 RABEP1Q15276 862 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ME3Q16798 604 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 MCTP2Q6DN12 878 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 BICD2Q8TD16 824 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 KIF2CQ99661 725 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CTAGE5O15320 804 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ARIH2O95376 493 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 GH1P01241 217 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 AP3B2Q13367 1082 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 LY6KQ17RY6 165 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 NLRX1Q86UT6 975 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 IL27Q8NEV9 243 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 COPS5Q92905 334 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 GTF3C6Q969F1 213 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CABYRO75952 493 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 PTGS1P23219 599 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 NECAB1Q8N987 351 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ST18O60284 1047 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 RGS20O76081 388 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 XBP1P17861 261 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 NLRP5P59047 1200 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 LAMC2Q13753 1193 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 WASF1Q92558 559 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ANO3Q9BYT9 981 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ELP1O95163 1332 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 STK36Q9NRP7 1315 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 FIBPO43427 364 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 KPNA6O60684 536 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 LARGE1O95461 756 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 RTP1P59025 263 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 CDHR1Q96JP9 859 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 BACH2Q9BYV9 841 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM260Q9NX78 707 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 A6NJR5 290 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-215ENST00000514625 MYL3P08590 195 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms