RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP1Q07960 439 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 HOMER1Q86YM7 354 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 C7orf31Q8N865 590 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOA7Q8NI08 942 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CAGE1Q8TC20 777 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE4AP27815 886 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 HSD17B4P51659 736 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 WTAPQ15007 396 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 USP38Q8NB14 1042 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9A7Q96T83 725 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR2MP0CAP2 368 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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SH3BP2-220ENST00000511663 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR8Q96EF0 704 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ALG1Q9BT22 464 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 IL25Q9H293 177 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH6P13533 1939 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP21A2P08686 494 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOGP15173 224 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMLP26374 656 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 GRM4Q14833 912 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PPTC7Q8NI37 304 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 VWCEQ96DN2 955 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 BAIAP3O94812 1187 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 CCND2P30279 289 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNJ6P48051 423 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PSEN2P49810 448 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRE1Q14246 886 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 IL27Q8NEV9 243 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 KAT2BQ92831 832 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PIGSQ96S52 555 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 THEGQ9P2T0 379 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-220ENST00000511663 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.32■■□□□ 1.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 OPLAHO14841 1288 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CA3P07451 260 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PGM5Q15124 567 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA33Q96N06 139 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.29■■□□□ 1.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 GGPS1O95749 300 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF286BP0CG31 522 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PTK7Q13308 1070 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO9BQ13459 2157 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 TLL1O43897 1013 aa22.28■■□□□ 1.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 F2P00734 622 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CKBP12277 381 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF5BP33176 963 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 TROAPQ12815 778 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 GNPTABQ3T906 1256 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CASC1Q6TDU7 716 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 ASB2Q96Q27 587 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CERS4Q9HA82 394 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0C4DFX4 3053 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-220ENST00000511663 HAS3O00219 553 aa22.27■■□□□ 1.16
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