RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NFKB2	Q00653	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593		B2RBV5	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NAT2	P11245	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	KLF4	O43474	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ITGAV	P06756	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CYP2C8	P10632	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	FPR2	P25090	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ECI1	P42126	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SV2C	Q496J9	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	GGN	Q86UU5	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	UBXN4	Q92575	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	PIF1	Q9H611	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	NTM	Q9P121	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CNR2	P34972	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	BCL6	P41182	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	GJA9	P57773	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	NACAD	O15069	1562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DDAH1	O94760	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ADRB1	P08588	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	HOXC12	P31275	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DIO2	Q92813	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SUSD5	O60279	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	LCP1	P13796	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	THBS2	P35442	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	STAT5A	P42229	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNJ6	P48051	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	KY	Q8NBH2	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593		X6R8D5	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593		K7ESM1	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	SCG5	P05408	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-208	ENST00000509593	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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