RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 CNTN2Q02246 1040 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 MAP2K5Q13163 448 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 PKP1Q13835 747 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 BRAPQ7Z569 592 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 DNERQ8NFT8 737 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 TNFRSF25Q93038 417 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 MCM3APO60318 1980 aa22.9■■□□□ 1.26
SMIM20-201ENST00000506197 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PXMP2Q9NR77 195 aa22.89■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.89■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.89■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 COBLO75128 1261 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 BRD1O95696 1058 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 F13A1P00488 732 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 RESTQ13127 1097 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 CCL14Q16627 93 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 TBCKQ8TEA7 893 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 SREBF1P36956 1147 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 INF2Q27J81 1249 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 FAM205CA6NFA0 338 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 CCND2P30279 289 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP4P98171 946 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 IWS1Q96ST2 819 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.86■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ASB14A6NK59 587 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 HOXC6P09630 235 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PDE4DQ08499 809 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PGM5Q15124 567 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NEK8Q86SG6 692 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF76P36508 570 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 MAML3Q96JK9 1138 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 FGD4Q96M96 766 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.84■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ASTN1O14525 1302 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 NR3C2P08235 984 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 ATP2B1P20020 1258 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 TRAPPC10P48553 1259 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 USP11P51784 963 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 LETM2Q2VYF4 491 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 IL31RAQ8NI17 732 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.83■■□□□ 1.25
SMIM20-201ENST00000506197 EVI5O60447 810 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 CYP3A4P08684 503 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 STXBP2Q15833 593 aa22.82■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 TCHHQ07283 1943 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 STAM2O75886 525 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 EDNRBP24530 442 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 TTC38Q5R3I4 469 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 ARMCX2Q7L311 632 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 TINF2Q9BSI4 451 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms